1. 國合會在生態環境部支持下設立秘書處，由生態環境部任命的1名秘書處主任具體負責，國合會秘書處是國合會日常運作的執行機構

2. 秘書處在秘書長的領導下，負責國合會日常運作的協調與管理，承擔國合會日常運行的任務。秘書處主要任務和職責是：

 (1) 支持、協調國合會及政策研究工作并開展后續工作；

 (2) 與首席顧問和秘書處國際支持辦公室合作準備提交秘書長會議審議的年度工作計劃及進展報告。

 (3) 負責國合會日常工作的正常運轉；

 (4) 組織和籌辦包括國合會年會、圓桌會議等各類會議，負責具體的會務安排；

 (5) 籌劃、組織國合會政策研討會/論壇等其他活動；

 (6) 協調、管理和組織國合會政策研究項目；

 (7) 與中方專家隊伍/單位簽訂開展國合會政策研究的合同；

 (8) 在秘書長指導下與首席顧問合作工作，為首席顧問配備必要資源并提供行政事務支持，組織召開秘書處-首席顧問聯合工作會議；

 (9) 建立與中國政府有關部門的密切聯系，并在必要時進行協調；

 (10) 確保國合會政策建議/成果傳播渠道的暢通；

 (11) 組織國合會年度政策報告、政策研究報告和其他出版物的出版；

 (12) 建立國合會運作與政策研究的管理程序；

 (13) 負責經費計劃與管理以及募集資金和接受捐助以及落實中國國內配套資金；

 (14) 制定國合會公共關系策略和宣傳計劃并組織實施；

 (15) 跟蹤國合會成果的后續發展情況。建立廣泛的合作伙伴關系，組織與其他國內外機構的合作;

 (16) 促進國合會的網絡建設與信息交流；

 (17) 承辦秘書長交辦的其他工作。

秘書處在開展國合會有關國際方面的活動時可以獲得來自秘書處國際支持辦公室的協助，該辦公室目前設在加拿大渥太華可持續發展研究院(IISD)。其主要職責是：

 (1) 作為其所在的主要捐助國開展國合會項目的執行機構；

 (2) 協助秘書處依據與相關方面達成的協議，管理國際捐助資金；

 (3) 按照捐助國的意愿及規定，作為相關捐助國的國際執行機構，接受并管理國際捐助資金；

 (4) 在必要時與參與國合會政策研究工作的外方專家簽訂合同，負責支付外方專家咨詢費用；并與外方首席顧問以及支持辦公室中的外方成員簽訂合同；

 (5) 協助籌備國合會年會，包括向參加國合會年會的外方委員提供國際旅行安排；

 (6) 協助制定國合會年度工作計劃，包括預算計劃以及國合會的其它活動；

 (7) 跟蹤國合會成果的后續發展情況；

 (8) 協助制定年度工作報告以及必要情況下的財務報告；

 (9) 為秘書處提供適當的培訓項目和技術支持。